Blog

Jan 02, 2024

Precisione della saliva per la SARS

BMC Infectious Diseases volume 23, numero articolo: 295 (2023) Cita questo articolo 905 Accessi 1 Dettagli parametrici alternativi Mentre i tamponi nasofaringei (NP) sono considerati il ​​gold standard per i casi gravi

BMC Infectious Diseases volume 23, numero articolo: 295 (2023) Citare questo articolo

905 accessi

1 Altmetrico

Dettagli sulle metriche

Sebbene i tamponi nasofaringei (NP) siano considerati il ​​gold standard per il rilevamento in tempo reale della reazione a catena della polimerasi-trascrittasi inversa (RT-PCR) del coronavirus respiratorio acuto grave 2 (SARS-CoV-2), diversi studi hanno dimostrato che la saliva è un campione alternativo per la diagnosi e lo screening del COVID-19.

Per analizzare l’utilità della saliva per la diagnosi di COVID-19 durante la circolazione della variante Omicron, i partecipanti sono stati arruolati in una coorte in corso progettata per valutare la storia naturale dell’infezione da SARS-CoV-2 negli adulti e nei bambini. Sensibilità, specificità, valore predittivo positivo (PPV), valore predittivo negativo (NPV) e coefficiente kappa di Cohen sono stati calcolati per valutare la prestazione diagnostica.

Complessivamente, sono stati raccolti 818 campioni da 365 pazienti ambulatoriali dal 3 gennaio al 2 febbraio 2022. L'età media era di 32,8 anni (intervallo: 3–94 anni). La RT-PCR per SARS-CoV-2 è stata confermata in 97/121 pazienti sintomatici (80,2%) e 62/244 (25,4%) pazienti asintomatici. È stata osservata una concordanza sostanziale tra la saliva e i campioni combinati nasofaringei/orofaringei con un valore kappa di Cohen di 0,74 [intervallo di confidenza (CI) al 95%: 0,67–0,81]. La sensibilità era del 77% (IC 95%: 70,9–82,2), specificità 95% (IC 95%: 91,9–97), PPV 89,8% (IC 95%: 83,1–94,4), NPV 87,9% (IC 95%: 83,6– 91,5) e accuratezza 88,5% (IC 95%: 85,0-91,4). La sensibilità era più elevata tra i campioni raccolti da bambini sintomatici di età pari o superiore a tre anni e da adolescenti [84% (IC 95%: 70,5–92)] con un valore kappa di Cohen di 0,63 (IC 95%: 0,35–0,91).

La saliva è un fluido affidabile per rilevare la SARS-CoV-2, soprattutto nei bambini e negli adolescenti sintomatici durante la circolazione della variante Omicron.

Rapporti di revisione tra pari

Il 26 novembre 2021, l'Organizzazione mondiale della sanità (OMS) ha designato il lignaggio B.1.1.529 come variante preoccupante (VOC) denominata Omicron, su consiglio del gruppo consultivo tecnico dell'OMS sull'evoluzione del virus [1]. All’inizio di gennaio 2022, Rio de Janeiro, in Brasile, ha registrato un notevole aumento dei casi di COVID-19. Studi di sequenziamento genomico condotti dalla rete di sorveglianza genomica della Fondazione Oswaldo Cruz (Fiocruz) e da altre istituzioni hanno suggerito che la variante Omicron era responsabile del 96% di questi casi (http://www.genomahcov.fiocruz.br/dashboard- en/) [2].

Sebbene i tamponi nasofaringei (NP) siano considerati il ​​gold standard per il rilevamento della reazione a catena della polimerasi-trascrittasi inversa in tempo reale (RT-PCR) della SARS-CoV-2, diversi studi hanno dimostrato che la saliva è un campione alternativo per la diagnosi e lo screening del COVID-19 [3,4,5,6], anche per persone asintomatiche e pazienti ambulatoriali [7, 8]. La raccolta della saliva non è invasiva ed è meglio tollerata e accettata rispetto ai tamponi [7]. Di conseguenza, si riduce il rischio di infezione per gli operatori sanitari e si riduce l’utilizzo dei dispositivi di protezione individuale poiché è possibile evitare l’interazione diretta tra operatori sanitari e pazienti [9, 10]. Yee et al. hanno osservato che le prestazioni della saliva e dei tamponi NP erano paragonabili per i pazienti pediatrici sintomatici e asintomatici [9]. Inoltre, uno studio ha mostrato una concordanza positiva del 100% per la variante Omicron nei tamponi di saliva rispetto ai tamponi accoppiati a turbinato medio [11].

Riportiamo l’accuratezza della saliva intera non stimolata (UWS) attraverso la sbavatura rispetto ai tamponi combinati nasofaringei e orofaringei profondi (OP) in pazienti ambulatoriali con sospetto COVID-19 e i loro contatti familiari. Abbiamo anche confrontato la distribuzione dei valori di soglia del ciclo (Ct) nell'UWS e nella combinazione NP/OP di pazienti asintomatici e sintomatici.

Le informazioni sui pazienti e i campioni clinici sono stati derivati ​​da uno studio di coorte aperto e prospettico progettato per valutare la storia naturale dell’infezione da SARS-CoV-2 negli adulti e nei bambini. Ai contatti residenti nello stesso domicilio del caso indice è stata offerta l'iscrizione allo studio. Adulti, adolescenti e bambini asintomatici e sintomatici sono stati reclutati presso l'Istituto nazionale di malattie infettive (INI) Evandro Chagas e il Centro sanitario Germano Sinval Faria [12], situato nella regione metropolitana di Rio de Janeiro durante il periodo di studio. Presso il Centro sanitario Germano Sinval Faria sono stati reclutati residenti della comunità di Manguinhos, una regione con caratteristiche socioeconomiche meno favorevoli. D'altra parte, i partecipanti reclutati presso l'ambulatorio (INI) provenivano da tutta la regione metropolitana di Rio de Janeiro, che comprende un numero di comuni lontani dalla capitale e con un profilo sociodemografico diverso.