I tamponi asciutti possono causare la SARS

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Dec 09, 2023

I tamponi asciutti possono causare la SARS

Data: 1.MAGGIO 2021 // Fonte: Clinical Laboratory News L'uso di "tamponi asciutti" può semplificare la raccolta dei campioni SARS-CoV-2, rendere superflui i mezzi di trasporto liquidi e mitigare i rischi per la sicurezza preservando

Data:MAGGIO.1.2021 //Fonte:Notizie di laboratorio clinico

Secondo i ricercatori, l’uso di “tamponi asciutti” può semplificare la raccolta dei campioni SARS-CoV-2, rendere superflui i mezzi di trasporto liquidi e mitigare i rischi per la sicurezza preservando l’accuratezza dei test (J Appl Lab Med 2021 Feb 25;doi:10.1093/jalm/jfab010).

I processi relativi all’uso di mezzi di trasporto universali (UTM) o mezzi di trasporto virale (VTM) utilizzati nei test SARS-CoV-2 creano problemi di biosicurezza perché possono generare aerosol e rifiuti infettivi. I tamponi asciutti potrebbero fornire un'alternativa perché consentono il trasporto dei tamponi di raccolta dei campioni in una provetta senza mezzi di trasporto liquidi. Al ricevimento, il laboratorio li idrata per l'analisi nei mezzi di trasporto. Questo processo relega gli aerosol in una cabina di sicurezza biologica, elimina la necessità di distribuire aliquote dei mezzi di raccolta al sito di raccolta e può eliminare la necessità di refrigerazione.

Per testare l’uso dei tamponi asciutti, i ricercatori hanno utilizzato un pool di campioni positivi alla SARS-CoV-2 per inoculare i tamponi floccati. Hanno immediatamente posizionato i tamponi floccati nell'UTM dopo l'inoculazione e hanno eseguito i test. Nel frattempo, i ricercatori hanno inserito 15 tamponi in provette coniche sterili da 15 ml e li hanno incubati a temperatura ambiente, alcuni per 1 giorno, altri per 2 e altri per 7 giorni. I ricercatori hanno ripetuto il protocollo per i mezzi di trasporto vitale (VTM) e la soluzione salina.

Per confronto, hanno anche preparato una serie di tamponi e li hanno testati in parallelo. Tuttavia, i ricercatori hanno conservato questi tamponi nei corrispondenti mezzi di trasporto liquidi UTM, VTM o soluzione salina e li hanno incubati a temperatura ambiente. Hanno quindi testato i tamponi a 1, 2 e 7 giorni dopo l’inoculazione e in duplicato. Hanno eseguito tutti i test utilizzando il test Roche cobas SARS-CoV-2.

I risultati dei tamponi asciutti testati ai giorni uno, due e sette rientravano entro le soglie di due cicli (Cts) rispetto ai valori Ct medi dei tamponi idratati nello stesso mezzo e testati il ​​giorno zero. I ricercatori non hanno riscontrato differenze statistiche nei valori Ct dei tamponi incubati in mezzi liquidi rispetto a quelli incubati in tamponi asciutti a temperatura ambiente prima dell'idratazione in mezzi liquidi.

I ricercatori hanno notato che la stabilità dell’acido nucleico SARS-CoV-2 sui campioni di tamponi asciutti giustifica un ulteriore studio della nuova tecnica di raccolta e trasporto dei campioni.

I ricercatori hanno identificato due gruppi circolanti di biomarcatori del cancro dell’adenocarcinoma duttale pancreatico (PDAC) che potrebbero portare alla diagnosi precoce di alcuni tumori potenzialmente curabili (Clin Cancer Res 2021; Mar 18: doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-4215).

Il PDAC è uno dei tumori letali più solidi, con la maggior parte dei pazienti diagnosticati in uno stadio avanzato quando la chirurgia non è più un'opzione. L’unico biomarcatore attualmente utile per monitorare i pazienti con PDAC dopo l’intervento chirurgico e durante altri trattamenti – l’antigene dei carboidrati 19-9 (CA19-9) – non è specifico.

I ricercatori hanno studiato 92 proteine ​​coinvolte nell’infiammazione, nello sviluppo e nella progressione del PDAC di 701 pazienti con PDAC di stadio I-IV, 102 pazienti con malattia pancreatica non maligna e 180 donatori di sangue sani. I ricercatori hanno misurato il CA19-9 plasmatico in tutti i campioni.

Due bioinformatici hanno lavorato in modo indipendente con modelli di regressione e hanno identificato due pannelli proteici ad alte prestazioni. Uno, chiamato indice I, conteneva 9 firme proteiche candidate, più CA19-9. L'altro, indice II, aveva 23 proteine ​​e CA1-19. Le proteine ​​incluse in entrambi gli indici sono coinvolte nell'apoptosi (CASP-8, FASLG e TRAIL), nell'immunosoppressione (CCL20, CD4, IL10, MMP-7, MIC-A/B e PD-L2), nell'infiammazione (CRTAM, IL8, CXCL1, IL33, CD40L, IL1a, CSF-1, IL5 e IL12), ipossia (LAMP-3), chemiotassi (MCP-3, CCL23 e CCL3) e rimodellamento vascolare (VEGFC).

Precedenti studi condotti su linee cellulari o pazienti PDAC hanno rilevato che alcune di queste proteine ​​sono associate o coinvolte nella malattia. IL8 e IL10 sono elevati nei pazienti con PDAC e sono correlati sia tra loro che con IL6, un noto biomarcatore prognostico nel PDAC. IL8 è una chemochina proinfiammatoria. La sua espressione è stimolata da varie citochine, ipossia e specie reattive dell'ossigeno. Le vie intracellulari attivate che portano all'espressione di IL8 includono NF-kB, PI3K-AKT e p38 MAPK. Sono note anche vie di segnalazione a valle del KRAS attivato, l'oncogene attivato in oltre il 90% dei tumori PDAC. Le cellule T regolatorie nel microambiente tumorale secernono IL10, contribuendo a un ambiente immunosoppressivo locale nei tumori PDAC.